Ostatky světce, uložené v hrobce katedrály Sv. Víta, nejsou

v současnosti k dispozici. Proto jsme pro vytvoření modelu lebky Jana Nepomuckého použili podrobnou dokumentaci dochovanou

po antropologické analýze Emanuela Vlčka v roce 1972. 

Sv. Jan Nepomucký byl na tehdejší dobu nadprůměrně vysoké postavy, ale slabší tělesné konstituce. Lebka je středné velikosti a nese znaky spíše ženské, přičemž tylní krajina a hranatá bradová partie působí výrazně mužsky. V době své smrti byl Jan Nepomucký asi 50 let stár.